Start kodon — Başlanğıc kodonu, məlumat RNT (mRNA) transkriptinin ribosom tərəfindən tərcümə olunan ilk kodondur. Ən ümumi başlanğıc kodonu AUQ(yəni müvafiq DNT ardıcıllığında ATQ). Başlanğıc kodundan əvvəl 5' tərcümə edilməmiş bölgə (5' UTR) gəlir. Prokariotlarda bu ribosomun bağlanma sahəsini əhatə edir . Başlanğıc kodundan əvvəl 5 'tərcümə edilməmiş bölgə (5' UTR) gəlir. Prokaryotlarda bu ribosomun bağlanma sahəsini əhatə edir.

Alternativ başlanğıc kodları
Alternativ başlanğıc kodonları standart AUQ kodonundan fərqlənir və həm prokaryotlarda (bakteriya və arxey) həm də eukaryotlarda olur. Alternativ başlanğıc kodonları, zülalın başlanğıcında olduqda (kodon fərqli bir amin turşusu kodlaşdırsaydı belə), Met olaraq tərcümə olunur. Bunun səbəbi, başlanğıc üçün ayrı bir nəqliyyat RNT-nin (tRNT) istifadə edilməsidir .
Eukariotlar
Alternativ başlanğıc kodonları (AUQ olmayan)eukaryotik genomlarda çox nadirdir. Bununla birlikdə, bəzi hüceyrə mRNT-lərı üçün AUQ xaricində təbii olaraq meydana gələn başlanğıc kodonları bildirilmişdir. AUQ-də mümkün olan doqquz mümkün tək əvəzetməsindən yeddisi, məməli hüceyrələrdə tərcümə başlanğıc yerləri kimi fəaliyyət göstərən dihidrofolat redüktazın kodon başlanğıcı.
Candida albicans, CAG başlanğıc kodundan istifadə edir. .
Prokariotlar
Prokaryotlar, əsasən QUQ və UUQ alternativ başlanğıc kodlarından çox istifadə edirlər. E. coli% 83 AUQ (3542/4284), 14% (612) QUQ, 3% (103) UUQ [8] və bir və ya iki digərini (məsələn, AUU və ehtimal ki, CUQ) istifadə edir.
AUG başlanğıc kodonları olmayan tanınmış kodlaşdırma bölgələri, E. coli'nin lak operonundakı (QUQ) və (UUQ) bölgələridir. Daha iki yeni tədqiqat müstəqil olaraq 17 və ya daha çox AUQ olmayan başlanğıc kodunun E. coli-də tərcüməyə başlaya biləcəyini göstərdi.
Mitoxondiri
Alternativ başlanğıc kodonları (insanlarda AUA və AUU) mitoxondrial genomlarda daha geniş istifadə olunur..
Standart genetik kod
AUQ kodonu metionini kodlayır və başlanğıc yeri kimi xidmət edir: m-RNT kodlaşdırma bölgəsindəki ilk AUQ, zülala çevrilməyə başlayır. GenBank tərəfindən siyahıya alınan digər başlanğıc kodonları,eukaryotlarda nadirdir və ümumiyyətlə Met / fMet üçün kodlardır.
Mühəndislik başlamaq kodonları
Qurulmuş təşəbbüskar tRNT-lar (CUA antikodonu olan tRNT fMet2), UAQ amber stop kodonunda tərcüməyə başlamaq üçün istifadə edilmişdir. Bu tip mühəndislik t RNT-sına ümumiyyətlə UAQ kodonlarında baş verən tərcümə dayandırma siqnalını boğduğu üçün cəfəng bir supressor tRNT adlanır.
İstinadlar
- Lobanov, A. V.; Turanov, A. A.; Hatfield, D. L.; Gladyshev, V. N. "Dual functions of codons in the genetic code". Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology. 45 (4). 2010: 257–65. doi:10.3109/10409231003786094. PMC 3311535. PMID 20446809.
- Ivanov, I. P.; Firth, A. E.; Michel, A. M.; Atkins, J. F.; Baranov, P. V. "Identification of evolutionarily conserved non-AUG-initiated N-terminal extensions in human coding sequences". Nucleic Acids Research. 39 (10). 2011: 4220–4234. doi:10.1093/nar/gkr007. PMC 3105428. PMID 21266472.
- Peabody, D. S. "Translation initiation at non-AUG triplets in mammalian cells". The Journal of Biological Chemistry. 264 (9). 1989: 5031–5. PMID 2538469.
- Starck, S. R.; Jiang, V; Pavon-Eternod, M; Prasad, S; McCarthy, B; Pan, T; Shastri, N. "Leucine-tRNA initiates at CUG start codons for protein synthesis and presentation by MHC class I". Science. 336 (6089). 2012: 1719–23. Bibcode:2012Sci...336.1719S. doi:10.1126/science.1220270. PMID 22745432.
- Dever, T. E. "Molecular biology. A new start for protein synthesis". Science. 336 (6089). 2012: 1645–6. doi:10.1126/science.1224439. PMID 22745408. 2022-06-08 tarixində arxivləşdirilib. İstifadə tarixi: 2021-05-26.
- Santos, MA; Keith, G; Tuite, MF. "Non-standard translational events in Candida albicans mediated by an unusual seryl-tRNA with a 5'-CAG-3' (leucine) anticodon". The EMBO Journal. 12 (2). February 1993: 607–16. doi:10.1002/j.1460-2075.1993.tb05693.x. PMC 413244. PMID 8440250.
- Blattner, F. R.; Plunkett g, G.; Bloch, C. A.; Perna, N. T.; Burland, V.; Riley, M.; Collado-Vides, J.; Glasner, J. D.; Rode, C. K.; Mayhew, G. F.; Gregor, J.; Davis, N. W.; Kirkpatrick, H. A.; Goeden, M. A.; Rose, D. J.; Mau, B.; Shao, Y. "The Complete Genome Sequence of Escherichia coli K-12". Science. 277 (5331). 1997: 1453–1462. doi:10.1126/science.277.5331.1453. PMID 9278503.
- Sacerdot, C.; Fayat, G.; Dessen, P.; Springer, M.; Plumbridge, J. A.; Grunberg-Manago, M.; Blanquet, S. "Sequence of a 1.26-kb DNA fragment containing the structural gene for E.coli initiation factor IF3: Presence of an AUU initiator codon". The EMBO Journal. 1 (3). 1982: 311–315. doi:10.1002/j.1460-2075.1982.tb01166.x. PMC 553041. PMID 6325158.
- Missiakas, D.; Georgopoulos, C.; Raina, S. "The Escherichia coli heat shock gene htpY: Mutational analysis, cloning, sequencing, and transcriptional regulation". Journal of Bacteriology. 175 (9). 1993: 2613–2624. doi:10.1128/jb.175.9.2613-2624.1993. PMC 204563. PMID 8478327.
- "E.coli lactose operon with lacI, lacZ, lacY and lacA genes GenBank: J01636.1". 2020-06-23 tarixində arxivləşdirilib. İstifadə tarixi: 2021-05-26.
- Firnberg, Elad; Labonte, Jason; Gray, Jeffrey; Ostermeir, Marc A. "A comprehensive, high-resolution map of a gene's fitness landscape". Molecular Biology & Evolution (ingilis). 31 (6). 2014: 1581–1592. doi:10.1093/molbev/msu081. PMC 4032126. PMID 24567513.
- Hecht, Ariel; Glasgow, Jeff; Jaschke, Paul R.; Bawazer, Lukmaan A.; Munson, Matthew S.; Cochran, Jennifer R.; Endy, Drew; Salit, Marc. "Measurements of translation initiation from all 64 codons in E. coli". Nucleic Acids Research (ingilis). 45 (7). 2017: 3615–3626. doi:10.1093/nar/gkx070. PMC 5397182. PMID 28334756.
- Elzanowski, Andrzej; Ostell, Jim. "The Genetic Codes". NCBI. 13 May 2011 tarixində arxivləşdirilib. İstifadə tarixi: 29 March 2019.
Bu məqalə . Məqaləni Vikipediyanı zənginləşdirə bilərsiniz. |
wikipedia, oxu, kitab, kitabxana, axtar, tap, meqaleler, kitablar, oyrenmek, wiki, bilgi, tarix, tarixi, endir, indir, yukle, izlə, izle, mobil, telefon ucun, azeri, azəri, azerbaycanca, azərbaycanca, sayt, yüklə, pulsuz, pulsuz yüklə, haqqında, haqqinda, məlumat, melumat, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, şəkil, muisiqi, mahnı, kino, film, kitab, oyun, oyunlar, android, ios, apple, samsung, iphone, pc, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, web, computer, komputer
Start kodon Baslangic kodonu melumat RNT mRNA transkriptinin ribosom terefinden tercume olunan ilk kodondur En umumi baslangic kodonu AUQ yeni muvafiq DNT ardicilliginda ATQ 1 Baslangic kodundan evvel 5 tercume edilmemis bolge 5 UTR gelir Prokariotlarda bu ribosomun baglanma sahesini ehate edir 2 Baslangic kodundan evvel 5 tercume edilmemis bolge 5 UTR gelir Prokaryotlarda bu ribosomun baglanma sahesini ehate edir 3 MT ATP6 insan mitokondrial DNT geninin kodonunu mavi daire baslayin Nukleotidlerin her ucluyu ucun kvadrat moterizeler muvafiq amin tursusu bir herfli kod verilir ya MT ATP8 ucun 1 oxu cercivesinde qirmizi ile ya da MT ATP6 ucun 3 cercivede mavi ile Genomun bu bolgesinde iki gen ust uste dusur Mundericat 1 Alternativ baslangic kodlari 1 1 Eukariotlar 1 2 Prokariotlar 1 3 Mitoxondiri 2 Standart genetik kod 3 Muhendislik baslamaq kodonlari 4 IstinadlarAlternativ baslangic kodlariredakteAlternativ baslangic kodonlari standart AUQ kodonundan ferqlenir ve hem prokaryotlarda bakteriya ve arxey hem de eukaryotlarda olur 4 Alternativ baslangic kodonlari zulalin baslangicinda olduqda kodon ferqli bir amin tursusu kodlasdirsaydi bele Met olaraq tercume olunur Bunun sebebi baslangic ucun ayri bir neqliyyat RNT nin tRNT istifade edilmesidir 5 Eukariotlarredakte Alternativ baslangic kodonlari AUQ olmayan eukaryotik genomlarda cox nadirdir Bununla birlikde bezi huceyre mRNT leri ucun AUQ xaricinde tebii olaraq meydana gelen baslangic kodonlari bildirilmisdir AUQ de mumkun olan doqquz mumkun tek nukleotid evezetmesinden yeddisi memeli huceyrelerde tercume baslangic yerleri kimi fealiyyet gosteren dihidrofolat reduktazin kodon baslangici Candida albicans CAG baslangic kodundan istifade edir 6 Prokariotlarredakte Prokaryotlar esasen QUQ ve UUQ alternativ baslangic kodlarindan cox istifade edirler 7 E coli 83 AUQ 3542 4284 14 612 QUQ 3 103 UUQ 8 ve bir ve ya iki digerini meselen AUU ve ehtimal ki CUQ istifade edir AUG baslangic kodonlari olmayan taninmis kodlasdirma bolgeleri E coli nin lak operonundaki QUQ ve UUQ bolgeleridir 8 Daha iki yeni tedqiqat musteqil olaraq 17 ve ya daha cox AUQ olmayan baslangic kodunun E coli de tercumeye baslaya bileceyini gosterdi 9 Mitoxondiriredakte Alternativ baslangic kodonlari insanlarda AUA ve AUU mitoxondrial genomlarda daha genis istifade olunur 10 Standart genetik kodredakteAUQ kodonu metionini kodlayir ve baslangic yeri kimi xidmet edir m RNT kodlasdirma bolgesindeki ilk AUQ zulala cevrilmeye baslayir 11 GenBank terefinden siyahiya alinan diger baslangic kodonlari eukaryotlarda nadirdir ve umumiyyetle Met fMet ucun kodlardir Muhendislik baslamaq kodonlariredakteQurulmus tesebbuskar tRNT lar CUA antikodonu olan tRNT fMet2 UAQ amber stop kodonunda tercumeye baslamaq ucun istifade edilmisdir 12 Bu tip muhendislik t RNT sina umumiyyetle UAQ kodonlarinda bas veren tercume dayandirma siqnalini bogdugu ucun cefeng bir supressor tRNT adlanir 13 Istinadlarredakte Lobanov A V Turanov A A Hatfield D L Gladyshev V N Dual functions of codons in the genetic code Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology 45 4 2010 257 65 doi 10 3109 10409231003786094 PMC 3311535 PMID 20446809 Ivanov I P Firth A E Michel A M Atkins J F Baranov P V Identification of evolutionarily conserved non AUG initiated N terminal extensions in human coding sequences Nucleic Acids Research 39 10 2011 4220 4234 doi 10 1093 nar gkr007 PMC 3105428 PMID 21266472 Peabody D S Translation initiation at non AUG triplets in mammalian cells The Journal of Biological Chemistry 264 9 1989 5031 5 PMID 2538469 Starck S R Jiang V Pavon Eternod M Prasad S McCarthy B Pan T Shastri N Leucine tRNA initiates at CUG start codons for protein synthesis and presentation by MHC class I Science 336 6089 2012 1719 23 Bibcode 2012Sci 336 1719S doi 10 1126 science 1220270 PMID 22745432 Dever T E Molecular biology A new start for protein synthesis Science 336 6089 2012 1645 6 doi 10 1126 science 1224439 PMID 22745408 2022 06 08 tarixinde arxivlesdirilib Istifade tarixi 2021 05 26 Santos MA Keith G Tuite MF Non standard translational events in Candida albicans mediated by an unusual seryl tRNA with a 5 CAG 3 leucine anticodon The EMBO Journal 12 2 February 1993 607 16 doi 10 1002 j 1460 2075 1993 tb05693 x PMC 413244 PMID 8440250 Blattner F R Plunkett g G Bloch C A Perna N T Burland V Riley M Collado Vides J Glasner J D Rode C K Mayhew G F Gregor J Davis N W Kirkpatrick H A Goeden M A Rose D J Mau B Shao Y The Complete Genome Sequence of Escherichia coli K 12 Science 277 5331 1997 1453 1462 doi 10 1126 science 277 5331 1453 PMID 9278503 Sacerdot C Fayat G Dessen P Springer M Plumbridge J A Grunberg Manago M Blanquet S Sequence of a 1 26 kb DNA fragment containing the structural gene for E coli initiation factor IF3 Presence of an AUU initiator codon The EMBO Journal 1 3 1982 311 315 doi 10 1002 j 1460 2075 1982 tb01166 x PMC 553041 PMID 6325158 Missiakas D Georgopoulos C Raina S The Escherichia coli heat shock gene htpY Mutational analysis cloning sequencing and transcriptional regulation Journal of Bacteriology 175 9 1993 2613 2624 doi 10 1128 jb 175 9 2613 2624 1993 PMC 204563 PMID 8478327 E coli lactose operon with lacI lacZ lacY and lacA genes GenBank J01636 1 2020 06 23 tarixinde arxivlesdirilib Istifade tarixi 2021 05 26 Firnberg Elad Labonte Jason Gray Jeffrey Ostermeir Marc A A comprehensive high resolution map of a gene s fitness landscape Molecular Biology amp Evolution ingilis 31 6 2014 1581 1592 doi 10 1093 molbev msu081 PMC 4032126 PMID 24567513 Hecht Ariel Glasgow Jeff Jaschke Paul R Bawazer Lukmaan A Munson Matthew S Cochran Jennifer R Endy Drew Salit Marc Measurements of translation initiation from all 64 codons in E coli Nucleic Acids Research ingilis 45 7 2017 3615 3626 doi 10 1093 nar gkx070 PMC 5397182 PMID 28334756 Elzanowski Andrzej Ostell Jim The Genetic Codes NCBI 13 May 2011 tarixinde arxivlesdirilib Istifade tarixi 29 March 2019 Bu meqale qaralama halindadir Meqaleni redakte ederek Vikipediyani zenginlesdire bilersiniz Bu sablon mumkundurse daha deqiqi ile evez edilmelidir Menbe https az wikipedia org w index php title Start kodon amp oldid 8118064