fbpx
Wikipedia

Start kodon

Avqust 05, 2021

Start kodon — Başlanğıc kodonu, məlumat RNT (mRNA) transkriptinin ribosom tərəfindən tərcümə olunan ilk kodondur. Ən ümumi başlanğıc kodonu AUQ(yəni müvafiq DNT ardıcıllığında ATQ). Başlanğıc kodundan əvvəl 5' tərcümə edilməmiş bölgə (5' UTR) gəlir. Prokariotlarda bu ribosomun bağlanma sahəsini əhatə edir . Başlanğıc kodundan əvvəl 5 'tərcümə edilməmiş bölgə (5' UTR) gəlir. Prokaryotlarda bu ribosomun bağlanma sahəsini əhatə edir.

MT-ATP6 insan mitokondrial DNT geninin kodonunu (mavi dairə) başlayın. Nükleotidlərin hər üçlüyü üçün (kvadrat mötərizələr) müvafiq amin turşusu (bir hərfli kod) verilir, ya MT-ATP8 üçün +1 oxu çərçivəsində (qırmızı ilə) ya da MT-ATP6 üçün +3 çərçivədə (mavi ilə). Genomun bu bölgəsində iki gen üst-üstə düşür.

Alternativ başlanğıc kodları

Alternativ başlanğıc kodonları standart AUQ kodonundan fərqlənir və həm prokaryotlarda (bakteriya və arxey) həm də eukaryotlarda olur. Alternativ başlanğıc kodonları, zülalın başlanğıcında olduqda (kodon fərqli bir amin turşusu kodlaşdırsaydı belə), Met olaraq tərcümə olunur. Bunun səbəbi, başlanğıc üçün ayrı bir nəqliyyat RNT-nin (tRNT) istifadə edilməsidir .

Eukariotlar

Alternativ başlanğıc kodonları (AUQ olmayan)eukaryotik genomlarda çox nadirdir. Bununla birlikdə, bəzi hüceyrə mRNT-lərı üçün AUQ xaricində təbii olaraq meydana gələn başlanğıc kodonları bildirilmişdir. AUQ-də mümkün olan doqquz mümkün tək nukleotid əvəzetməsindən yeddisi, məməli hüceyrələrdə tərcümə başlanğıc yerləri kimi fəaliyyət göstərən dihidrofolat redüktazın kodon başlanğıcı.

Candida albicans, CAG başlanğıc kodundan istifadə edir. .

Prokariotlar

Prokaryotlar, əsasən QUQ və UUQ alternativ başlanğıc kodlarından çox istifadə edirlər. E. coli% 83 AUQ (3542/4284), 14% (612) QUQ, 3% (103) UUQ [8] və bir və ya iki digərini (məsələn, AUU və ehtimal ki, CUQ) istifadə edir.

AUG başlanğıc kodonları olmayan tanınmış kodlaşdırma bölgələri, E. coli'nin lak operonundakı (QUQ) və (UUQ) bölgələridir. Daha iki yeni tədqiqat müstəqil olaraq 17 və ya daha çox AUQ olmayan başlanğıc kodunun E. coli-də tərcüməyə başlaya biləcəyini göstərdi.

Mitoxondiri

Alternativ başlanğıc kodonları (insanlarda AUA və AUU) mitoxondrial genomlarda daha geniş istifadə olunur..

Standart genetik kod

AUQ kodonu metionini kodlayır və başlanğıc yeri kimi xidmət edir: m-RNT kodlaşdırma bölgəsindəki ilk AUQ, zülala çevrilməyə başlayır. GenBank tərəfindən siyahıya alınan digər başlanğıc kodonları,eukaryotlarda nadirdir və ümumiyyətlə Met / fMet üçün kodlardır.

Mühəndislik başlamaq kodonları

Qurulmuş təşəbbüskar tRNT-lar (CUA antikodonu olan tRNT fMet2), UAQ amber stop kodonunda tərcüməyə başlamaq üçün istifadə edilmişdir . Bu tip mühəndislik t RNT-sına ümumiyyətlə UAQ kodonlarında baş verən tərcümə dayandırma siqnalını boğduğu üçün cəfəng bir supressor tRNT adlanır.

İstinadlar

  1. Lobanov, A. V.; Turanov, A. A.; Hatfield, D. L.; Gladyshev, V. N. (2010). "Dual functions of codons in the genetic code". Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology. 45 (4): 257–65. doi:10.3109/10409231003786094. PMC 3311535. PMID 20446809.
  2. Ivanov, I. P.; Firth, A. E.; Michel, A. M.; Atkins, J. F.; Baranov, P. V. (2011). "Identification of evolutionarily conserved non-AUG-initiated N-terminal extensions in human coding sequences". Nucleic Acids Research. 39 (10): 4220–4234. doi:10.1093/nar/gkr007. PMC 3105428. PMID 21266472. (#parameter_ignored)
  3. Peabody, D. S. (1989). "Translation initiation at non-AUG triplets in mammalian cells". The Journal of Biological Chemistry. 264 (9): 5031–5. PMID 2538469.
  4. Starck, S. R.; Jiang, V; Pavon-Eternod, M; Prasad, S; McCarthy, B; Pan, T; Shastri, N (2012). "Leucine-tRNA initiates at CUG start codons for protein synthesis and presentation by MHC class I". Science. 336 (6089): 1719–23. Bibcode:2012Sci...336.1719S. doi:10.1126/science.1220270. PMID 22745432.
  5. Dever, T. E. (2012). "Molecular biology. A new start for protein synthesis". Science. 336 (6089): 1645–6. doi:10.1126/science.1224439. PMID 22745408.
  6. Santos, MA; Keith, G; Tuite, MF (February 1993). "Non-standard translational events in Candida albicans mediated by an unusual seryl-tRNA with a 5'-CAG-3' (leucine) anticodon". The EMBO Journal. 12 (2): 607–16. doi:10.1002/j.1460-2075.1993.tb05693.x. PMC 413244. PMID 8440250.
  7. Blattner, F. R.; Plunkett g, G.; Bloch, C. A.; Perna, N. T.; Burland, V.; Riley, M.; Collado-Vides, J.; Glasner, J. D.; Rode, C. K.; Mayhew, G. F.; Gregor, J.; Davis, N. W.; Kirkpatrick, H. A.; Goeden, M. A.; Rose, D. J.; Mau, B.; Shao, Y. (1997). "The Complete Genome Sequence of Escherichia coli K-12". Science. 277 (5331): 1453–1462. doi:10.1126/science.277.5331.1453. PMID 9278503.
  8. Sacerdot, C.; Fayat, G.; Dessen, P.; Springer, M.; Plumbridge, J. A.; Grunberg-Manago, M.; Blanquet, S. (1982). "Sequence of a 1.26-kb DNA fragment containing the structural gene for E.coli initiation factor IF3: Presence of an AUU initiator codon". The EMBO Journal. 1 (3): 311–315. doi:10.1002/j.1460-2075.1982.tb01166.x. PMC 553041. PMID 6325158.
  9. Missiakas, D.; Georgopoulos, C.; Raina, S. (1993). "The Escherichia coli heat shock gene htpY: Mutational analysis, cloning, sequencing, and transcriptional regulation". Journal of Bacteriology. 175 (9): 2613–2624. doi:10.1128/jb.175.9.2613-2624.1993. PMC 204563. PMID 8478327.
  10. E.coli lactose operon with lacI, lacZ, lacY and lacA genes GenBank: J01636.1
  11. Firnberg, Elad; Labonte, Jason; Gray, Jeffrey; Ostermeir, Marc A. (2014). "A comprehensive, high-resolution map of a gene's fitness landscape". Molecular Biology & Evolution (ingilis). 31 (6): 1581–1592. doi:10.1093/molbev/msu081. PMC 4032126. PMID 24567513.
  12. Hecht, Ariel; Glasgow, Jeff; Jaschke, Paul R.; Bawazer, Lukmaan A.; Munson, Matthew S.; Cochran, Jennifer R.; Endy, Drew; Salit, Marc (2017). "Measurements of translation initiation from all 64 codons in E. coli". Nucleic Acids Research (ingilis). 45 (7): 3615–3626. doi:10.1093/nar/gkx070. PMC 5397182. PMID 28334756.
  13. Elzanowski, Andrzej; Ostell, Jim. "The Genetic Codes". NCBI. İstifadə tarixi: 29 March 2019.
  Bu məqalə qaralama halındadır. Məqaləni redaktə edərək Vikipediyaya kömək edə bilərsiniz.
Əgər mümkündürsə, daha dəqiq bir şablondan istifadə edin.
Bu məqalə sonuncu dəfə 27 gün əvvəl TexnoBot tərəfindən redaktə olunub. (Yenilə)

Avqust 05, 2021
start, kodon, başlanğıc, kodonu, məlumat, mrna, transkriptinin, ribosom, tərəfindən, tərcümə, olunan, kodondur, ümumi, başlanğıc, kodonu, yəni, müvafiq, ardıcıllığında, başlanğıc, kodundan, əvvəl, tərcümə, edilməmiş, bölgə, gəlir, prokariotlarda, ribosomun, ba. Start kodon Baslangic kodonu melumat RNT mRNA transkriptinin ribosom terefinden tercume olunan ilk kodondur En umumi baslangic kodonu AUQ yeni muvafiq DNT ardicilliginda ATQ 1 Baslangic kodundan evvel 5 tercume edilmemis bolge 5 UTR gelir Prokariotlarda bu ribosomun baglanma sahesini ehate edir 2 Baslangic kodundan evvel 5 tercume edilmemis bolge 5 UTR gelir Prokaryotlarda bu ribosomun baglanma sahesini ehate edir 3 MT ATP6 insan mitokondrial DNT geninin kodonunu mavi daire baslayin Nukleotidlerin her ucluyu ucun kvadrat moterizeler muvafiq amin tursusu bir herfli kod verilir ya MT ATP8 ucun 1 oxu cercivesinde qirmizi ile ya da MT ATP6 ucun 3 cercivede mavi ile Genomun bu bolgesinde iki gen ust uste dusur Mundericat 1 Alternativ baslangic kodlari 1 1 Eukariotlar 1 2 Prokariotlar 1 3 Mitoxondiri 2 Standart genetik kod 3 Muhendislik baslamaq kodonlari 4 IstinadlarAlternativ baslangic kodlari RedakteAlternativ baslangic kodonlari standart AUQ kodonundan ferqlenir ve hem prokaryotlarda bakteriya ve arxey hem de eukaryotlarda olur 4 Alternativ baslangic kodonlari zulalin baslangicinda olduqda kodon ferqli bir amin tursusu kodlasdirsaydi bele Met olaraq tercume olunur Bunun sebebi baslangic ucun ayri bir neqliyyat RNT nin tRNT istifade edilmesidir 5 Eukariotlar Redakte Alternativ baslangic kodonlari AUQ olmayan eukaryotik genomlarda cox nadirdir Bununla birlikde bezi huceyre mRNT leri ucun AUQ xaricinde tebii olaraq meydana gelen baslangic kodonlari bildirilmisdir AUQ de mumkun olan doqquz mumkun tek nukleotid evezetmesinden yeddisi memeli huceyrelerde tercume baslangic yerleri kimi fealiyyet gosteren dihidrofolat reduktazin kodon baslangici Candida albicans CAG baslangic kodundan istifade edir 6 Prokariotlar Redakte Prokaryotlar esasen QUQ ve UUQ alternativ baslangic kodlarindan cox istifade edirler 7 E coli 83 AUQ 3542 4284 14 612 QUQ 3 103 UUQ 8 ve bir ve ya iki digerini meselen AUU ve ehtimal ki CUQ istifade edir AUG baslangic kodonlari olmayan taninmis kodlasdirma bolgeleri E coli nin lak operonundaki QUQ ve UUQ bolgeleridir 8 Daha iki yeni tedqiqat musteqil olaraq 17 ve ya daha cox AUQ olmayan baslangic kodunun E coli de tercumeye baslaya bileceyini gosterdi 9 Mitoxondiri Redakte Alternativ baslangic kodonlari insanlarda AUA ve AUU mitoxondrial genomlarda daha genis istifade olunur 10 Standart genetik kod RedakteAUQ kodonu metionini kodlayir ve baslangic yeri kimi xidmet edir m RNT kodlasdirma bolgesindeki ilk AUQ zulala cevrilmeye baslayir 11 GenBank terefinden siyahiya alinan diger baslangic kodonlari eukaryotlarda nadirdir ve umumiyyetle Met fMet ucun kodlardir Muhendislik baslamaq kodonlari RedakteQurulmus tesebbuskar tRNT lar CUA antikodonu olan tRNT fMet2 UAQ amber stop kodonunda tercumeye baslamaq ucun istifade edilmisdir 12 Bu tip muhendislik t RNT sina umumiyyetle UAQ kodonlarinda bas veren tercume dayandirma siqnalini bogdugu ucun cefeng bir supressor tRNT adlanir 13 Istinadlar Redakte Lobanov A V Turanov A A Hatfield D L Gladyshev V N 2010 Dual functions of codons in the genetic code Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology 45 4 257 65 doi 10 3109 10409231003786094 PMC 3311535 PMID 20446809 Ivanov I P Firth A E Michel A M Atkins J F Baranov P V 2011 Identification of evolutionarily conserved non AUG initiated N terminal extensions in human coding sequences Nucleic Acids Research 39 10 4220 4234 doi 10 1093 nar gkr007 PMC 3105428 PMID 21266472 parameter ignored Peabody D S 1989 Translation initiation at non AUG triplets in mammalian cells The Journal of Biological Chemistry 264 9 5031 5 PMID 2538469 Starck S R Jiang V Pavon Eternod M Prasad S McCarthy B Pan T Shastri N 2012 Leucine tRNA initiates at CUG start codons for protein synthesis and presentation by MHC class I Science 336 6089 1719 23 Bibcode 2012Sci 336 1719S doi 10 1126 science 1220270 PMID 22745432 Dever T E 2012 Molecular biology A new start for protein synthesis Science 336 6089 1645 6 doi 10 1126 science 1224439 PMID 22745408 Santos MA Keith G Tuite MF February 1993 Non standard translational events in Candida albicans mediated by an unusual seryl tRNA with a 5 CAG 3 leucine anticodon The EMBO Journal 12 2 607 16 doi 10 1002 j 1460 2075 1993 tb05693 x PMC 413244 PMID 8440250 Blattner F R Plunkett g G Bloch C A Perna N T Burland V Riley M Collado Vides J Glasner J D Rode C K Mayhew G F Gregor J Davis N W Kirkpatrick H A Goeden M A Rose D J Mau B Shao Y 1997 The Complete Genome Sequence of Escherichia coli K 12 Science 277 5331 1453 1462 doi 10 1126 science 277 5331 1453 PMID 9278503 Sacerdot C Fayat G Dessen P Springer M Plumbridge J A Grunberg Manago M Blanquet S 1982 Sequence of a 1 26 kb DNA fragment containing the structural gene for E coli initiation factor IF3 Presence of an AUU initiator codon The EMBO Journal 1 3 311 315 doi 10 1002 j 1460 2075 1982 tb01166 x PMC 553041 PMID 6325158 Missiakas D Georgopoulos C Raina S 1993 The Escherichia coli heat shock gene htpY Mutational analysis cloning sequencing and transcriptional regulation Journal of Bacteriology 175 9 2613 2624 doi 10 1128 jb 175 9 2613 2624 1993 PMC 204563 PMID 8478327 E coli lactose operon with lacI lacZ lacY and lacA genes GenBank J01636 1 Firnberg Elad Labonte Jason Gray Jeffrey Ostermeir Marc A 2014 A comprehensive high resolution map of a gene s fitness landscape Molecular Biology amp Evolution ingilis 31 6 1581 1592 doi 10 1093 molbev msu081 PMC 4032126 PMID 24567513 Hecht Ariel Glasgow Jeff Jaschke Paul R Bawazer Lukmaan A Munson Matthew S Cochran Jennifer R Endy Drew Salit Marc 2017 Measurements of translation initiation from all 64 codons in E coli Nucleic Acids Research ingilis 45 7 3615 3626 doi 10 1093 nar gkx070 PMC 5397182 PMID 28334756 Elzanowski Andrzej Ostell Jim The Genetic Codes NCBI Istifade tarixi 29 March 2019 Bu meqale qaralama halindadir Meqaleni redakte ederek Vikipediyaya komek ede bilersiniz Eger mumkundurse daha deqiq bir sablondan istifade edin Bu meqale sonuncu defe 27 gun evvel TexnoBot terefinden redakte olunub Yenile Menbe https az wikipedia org w index php title Start kodon amp oldid 6043741, wikipedia, oxu, kitab, kitabxana, axtar, tap, hersey,

ne axtarsan burda

, en yaxsi meqale sayti, meqaleler, kitablar, oyrenmek, wiki, bilgi, tarix, seks, porno, indir, yukle, sex, azeri sex, azeri, seks yukle, sex yukle, izle, seks izle, porno izle, mobil seks, telefon ucun, chat, azeri chat, tanisliq, tanishliq, azeri tanishliq, sayt, medeni, medeni saytlar, chatlar, mekan, tanisliq mekani, mekanlari, yüklə, pulsuz, pulsuz yüklə, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, şəkil, muisiqi, mahnı, kino, film, kitab, oyun, oyunlar.